Tem de enganar o Access porque pressupõe que não está interessado num número automático diferente daquele que ele fornece.
Terá de começar a tabela com o número automático personalizado, o que exigirá alguma configuração. Mas, uma vez que se vá embora, pode simplesmente continuar a adicionar a partir daí.
Google “access change autonumber start” e encontrará várias opções para o fazer. A maioria depende da criação de uma consulta em apêndice para modificar o campo.
Criar a primeira tabela que contém o campo de tipo de contador que pretende iniciar noutro número. Não introduza nenhum registo. Crie uma segunda tabela, com um único campo de tipo de número inteiro longo que tenha o mesmo nome que o campo do contador na primeira tabela. Crie um registo na segunda tabela, introduzindo um número um a menos do que o número em que pretende iniciar o contador na primeira tabela. Crie uma consulta anexa, para anexar o único registo da segunda tabela à primeira tabela, e execute-a Apagar a segunda tabela, apagar o registo que anexou à primeira tabela, e começar a introduzir dados.
A partir de MVPS.org http://access.mvps.org/access/tables/tbl0005.htm
Se não lhe apetecer construir uma consulta anexa, pode sempre configurar a tabela e copiar e colar 1000 linhas de dados fictícios do excel, apagar os registos até chegar ao número 1001, e continuar a partir daí.
ACTUALIZAÇÃO: Adicionando a explicação da razão
A razão por detrás do número automático ser apenas definido para começar a partir de 1 é que o campo do número automático se destina a ser usado como campo de referência interno, e na boa prática da base de dados, não deve geralmente ser usado em qualquer forma visível ao público. É utilizado nos casos em que ainda não existe um item único numa determinada tabela para criar uma entrada única através da qual a tabela pode ser pesquisada e indexada.