/F Fixes errors on the disk./R Locates bad sectors and recovers readable information (implies /F).
(de dir /?)
& A mim parece-me a mesma coisa. Nunca sei qual usar - há sequer uma diferença? Ou será talvez para compatibilidade com versões anteriores do Windows onde havia uma diferença?
chkdsk /r faz a mesma coisa que chkdsk /f só que também verifica se existem maus sectores no disco e recupera qualquer informação legível. A execução chkdsk /r implica que também o chkdsk /f é executado.
chkdsk /f apenas verifica a existência de erros no disco, e não de sectores maus.
Microsoft tem uma página detalhada para chkdsk . O que se segue é uma explicação dos parâmetros /f e /r.
Fixar erros de disco:
Chkdsk corrige erros de disco apenas se especificar a opção /f da linha de comando. A Chkdsk deve ser capaz de bloquear a unidade para corrigir erros. Como as reparações normalmente alteram a tabela de atribuição de ficheiros*** de um disco e por vezes causam uma perda de dados, a Chkdsk envia uma mensagem de confirmação.
& > De encontrar erros físicos do disco:
Use a opção /r da linha de comando para encontrar erros físicos do disco no sistema de ficheiros.