Usar pesquisa de expressão regular, pesquisa por ^........................... e substituir por (cordel vazio).
Infelizmente, o Notepad+++ não suporta contagens de repetição como ^.{27} - a documentação SciTE regexp também se aplica aqui.
Em alternativa, utilizar a selecção rectangular de várias linhas (prima Alt enquanto selecciona) para seleccionar estes primeiros 27 caracteres em cada linha, depois prima Delete ou Backspace.
Usando ferramentas Unix (por exemplo Cygwin, UnxUtils) pode usar cut -c28- ou sed -E "s|^.{27}||" em vez disso. Pelo menos, estas são as chamadas de linha de comando do Linux que utilizaria.