Embora o Chrome não forneça uma IU para limpar o localStorage, existe uma API que irá limpar uma chave específica ou todo o objecto localStorage num website.
//Clears the value of MyKey
window.localStorage.removeItem("MyKey");
//Clears all the local storage data
window.localStorage.clear();
Cada navegador Chrome, por defeito, tem a consola JavaScript instalada. Assim, um método alternativo, e talvez a forma mais fácil, de limpar o localStorage é clicar com o botão direito na página, clicar em “Inspect Element”, depois clicar no separador “Console”. Quando a consola abrir, escreva o seguinte JavaScript, e prima enter:
window.localStorage.clear()
Uma vez terminado, o localStorage será limpo. Note que isto afecta todas as páginas web num único domínio, por isso se limpar o localStorage para jsfiddle.net/index.html (assumindo que é a página em que se encontra), então limpa-a para todas as outras páginas desse site. Veja HTML5Goodies - A Peek into Local Data Storage in HTML 5 para mais informações.